Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPN3P20807 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms