Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LBPP18428 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LBPP18428 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LBPP18428 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LBPP18428 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LBPP18428 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LBPP18428 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LBPP18428 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LBPP18428 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LBPP18428 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LBPP18428 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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