Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XBP1P17861 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XBP1P17861 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
XBP1P17861 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XBP1P17861 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms