Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPB42P16452 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPB42P16452 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPB42P16452 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPB42P16452 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPB42P16452 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPB42P16452 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPB42P16452 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPB42P16452 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms