Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPCAMP16422 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms