Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP9P0CG40 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms