Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00032P0C843 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms