Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT34O76011 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT34O76011 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT34O76011 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT34O76011 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT34O76011 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms