Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKAP2O75563 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms