Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCN2BO60939 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms