Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBDO15205 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBDO15205 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBDO15205 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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