Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01387J3KSC0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LINC01387J3KSC0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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