Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms