Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F8W031 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F8W031 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F8W031 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms