Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NPIPB15A6NHN6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NPIPB15A6NHN6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NPIPB15A6NHN6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB15A6NHN6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms