Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms