Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TARSL2A2RTX5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms