Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD2APQ9Y5K6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD2APQ9Y5K6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD2APQ9Y5K6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD2APQ9Y5K6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD2APQ9Y5K6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CD2APQ9Y5K6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD2APQ9Y5K6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD2APQ9Y5K6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms