Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP1Q9Y3L3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms