Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRKBQ9Y3C4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRKBQ9Y3C4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms