Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B6Q9Y3B4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B6Q9Y3B4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms