Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG3Q9Y2Y8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms