Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX12Q9UMY4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX12Q9UMY4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms