Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BARX2Q9UMQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BARX2Q9UMQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms