Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI4Q9UM07 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI4Q9UM07 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms