Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRTO4Q9UKD2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRTO4Q9UKD2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRTO4Q9UKD2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms