Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMP5Q9UJQ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMP5Q9UJQ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms