Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRAQ9UJ68 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSRAQ9UJ68 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSRAQ9UJ68 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms