Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HERC5Q9UII4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HERC5Q9UII4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC5Q9UII4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms