Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3BQ9UH17 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms