Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP1R1BQ9UD71 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP1R1BQ9UD71 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPP1R1BQ9UD71 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms