Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCD2Q9UBJ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD2Q9UBJ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD2Q9UBJ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms