Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC17A7Q9P2U7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A7Q9P2U7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A7Q9P2U7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms