Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
REREQ9P2R6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
REREQ9P2R6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
REREQ9P2R6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
REREQ9P2R6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.5 ms