Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNKQ9P0W0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNKQ9P0W0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms