Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACD3Q9P035 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD3Q9P035 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms