Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC59Q9P031 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC59Q9P031 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms