Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBAP1Q9NZ09 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBAP1Q9NZ09 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBAP1Q9NZ09 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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