Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VNN3Q9NY84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VNN3Q9NY84 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms