Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL12Q9NXK8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL12Q9NXK8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL12Q9NXK8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL12Q9NXK8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL12Q9NXK8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL12Q9NXK8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXL12Q9NXK8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL12Q9NXK8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL12Q9NXK8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms