Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM6Q9NX76 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM6Q9NX76 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM6Q9NX76 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM6Q9NX76 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM6Q9NX76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM6Q9NX76 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM6Q9NX76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CMTM6Q9NX76 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMTM6Q9NX76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM6Q9NX76 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM6Q9NX76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM6Q9NX76 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms