Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRNAU1APQ9NX07 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRNAU1APQ9NX07 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms