Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLIMQ9NVW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLIMQ9NVW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms