Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF13Q9NV06 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms