Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC3Q9NUV7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC3Q9NUV7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms