Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC18Q9NUE0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC18Q9NUE0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC18Q9NUE0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms