Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1GALT1Q9NS00 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1GALT1Q9NS00 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1GALT1Q9NS00 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms