Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLDQ9NQC7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLDQ9NQC7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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