Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms