Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRC4Q9NPP4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRC4Q9NPP4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRC4Q9NPP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms